新聞應(yīng)用
更新時間:2024-09-25 瀏覽次數(shù):789
自動化設(shè)備的發(fā)展有助于實驗室的重復(fù)程序標(biāo)準(zhǔn)化。在微觀領(lǐng)域里,單菌落的涂布和分離是任何微生物學(xué)和分子生物學(xué)研究過程中不可缺少的,盡管自動化設(shè)備有明顯的好處,但在自動機器人平臺上涂布細(xì)胞依然沒有被廣泛采用,很大程度上是由于目前機器人解決方案的不一致性和低通量造成的(一次涂布一個樣品)。但是如果一次處理數(shù)十萬個樣品,這明顯就不現(xiàn)實了。
SINGER公司針對這個問題開發(fā)了一個解決方案:整合優(yōu)化ROTOR+的高通量涂布程序,該程序為研究人員提供在兩分鐘內(nèi)在單個平皿上涂布96個樣本的能力,這不僅節(jié)省寶貴時間和資源,也是一個真正的高通量的方法!
ROTOR+用定制針板涂布細(xì)胞
為了利用ROTOR+液體到瓊脂的轉(zhuǎn)移功能,SINGER開發(fā)了一種使用96密度長針RePads將細(xì)胞從96孔板轉(zhuǎn)移到瓊脂板的涂布方案。方案中,ROTOR+在一個矩形瓊脂平板上為96個樣品點種7×7矩陣,一旦ROTOR+從96孔板上取下樣品,它就會重復(fù)地在瓊脂板上定位點種,不需要返回來源板。隨著ROTOR+針尖的反復(fù)點種矩陣,針尖上的細(xì)胞被稀釋,這樣單菌落就形成了(圖1)。
圖片注釋:ROTOR+從96孔源板上蘸取菌液,點種到7×7矩陣的瓊脂板上。孵育后,所有96個樣品均可觀察到單個菌落
另一方面,為了評估ROTOR+涂布方案能夠涂布酵母和細(xì)菌細(xì)胞的有效性,將釀酒酵母培養(yǎng)過夜,對隔夜培養(yǎng)物進(jìn)行了2倍稀釋,并將細(xì)胞點種在Plusplate上(圖2a)。在30°C孵育48小時后,我們觀察到一系列稀釋后的單菌落。
涂布好的釀酒酵母在30°C孵育48小時
我們對畢赤酵母(圖2b)和大腸桿菌(圖2c)重復(fù)了相同的實驗,結(jié)果是一致的,我們觀察到在不同的稀釋倍數(shù)下單菌落的生長情況。這表明7×7矩陣涂布方案適用于一系列微生物,包括酵母和細(xì)菌細(xì)胞。
涂布好的畢赤酵母在30°C孵育36小時
涂布好的大腸桿菌在37°C孵育18小時
2倍連續(xù)稀釋結(jié)果表明,對于許多樣品,1:16到1:128稀釋會產(chǎn)生單個菌落。因此,我們用1:32稀釋的酵母隔夜培養(yǎng)重復(fù)了這個實驗,證實我們的結(jié)論。得到的圖像(圖3)顯示,每個樣本在其矩陣中都有明確的單個菌落,而且沒有菌落間的交叉污染。
將釀酒酵母隔夜培養(yǎng)物稀釋1:32,并將其涂在瓊脂上。培養(yǎng)皿在30℃下培養(yǎng)36小時
該方案還能涂布大腸桿菌轉(zhuǎn)化株細(xì)胞。大腸桿菌轉(zhuǎn)化是常見的實驗方法,大量的轉(zhuǎn)化子需要被涂布以挑選單個菌落。為了確定ROTOR+的7×7陣列方法是否能夠涂布轉(zhuǎn)化后的大腸桿菌細(xì)胞,我們用a)編碼GFP的質(zhì)粒、b)空載體、c)不帶任何質(zhì)粒的dH2O轉(zhuǎn)化大腸桿菌。我們的數(shù)據(jù)表明,當(dāng)細(xì)胞用質(zhì)粒轉(zhuǎn)化時,我們能夠在LB
+ Kan平板上獲得單菌落,而沒有質(zhì)粒轉(zhuǎn)化的細(xì)胞不能存活,不能在選擇性培養(yǎng)基上生長(圖4a)
為了測試轉(zhuǎn)化的特異性,我們使用能夠檢測GFP信號的PhenoBooth對平板進(jìn)行成像。正如預(yù)期的那樣,用GFP質(zhì)粒轉(zhuǎn)化的細(xì)胞顯示出強烈的GFP信號,而用空載體轉(zhuǎn)化的細(xì)胞則沒有(圖4b)。
用GFP載體或空載體轉(zhuǎn)化的細(xì)胞在平板上形成菌落,而用水轉(zhuǎn)化的細(xì)胞不能形成菌落
用PhenoBooth對平板進(jìn)行紫外檢測,GFP信號成像。用GFP載體轉(zhuǎn)化的細(xì)胞形成帶有GFP信號的菌落,而用空載體轉(zhuǎn)化的細(xì)胞不能發(fā)出熒光
ROTOR+的7×7矩陣程序可以自動化高通量地涂布微生物菌落形成單菌落,研究人員只需使用一個96長針RePad在不到兩分鐘的時間內(nèi)將96個樣品涂布在一個目標(biāo)板上。ROTOR+提供了一個真正的高通量和低成本的解決方案,只需1.25秒,極大的為科研節(jié)省了時間、資源和金錢。
ROTOR+的矩陣插件是一個很靈活強大的系統(tǒng),默認(rèn)的7×7矩陣是完全可以實現(xiàn)單菌落分離的,在整個自動化流程中,搭配PIXL挑菌使用效果更佳。PIXL是一款極其可靠、易用的微生物菌落挑選工作站。自動成像、識別、篩選、挑取菌落,從瓊脂平皿挑菌到瓊脂或到液體多孔板,也可從液體多孔板到瓊脂平皿。
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